- 전공의 임명 및 진급내신과 근무성적의 평가/관리
- 전공의 수련계획 수립 및 운영
- 전공의 신상관리 및 전공의 임용등록에 관한 업무
- 군전공의 요원관리에 관한 업무
- 전공의 파견교육에 관한 업무
- 전공의 행사 및 전공의 행정사무 처리
- 전공의 정원관리
- 전공의 후생 복지에 관한 업무
- 전공의 관련 제증명서 발급
- 전공의 선발 관련 의과대학 설명회 개최